Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 PAIP2B-201ENST00000244221 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
LRRIQ1Q96JM4 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
LRRIQ1Q96JM4 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms