Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 ZNF736-202ENST00000423484 7119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 B4GALNT2-202ENST00000393354 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 DRP2-205ENST00000541709 6835 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 SCAND2P-201ENST00000348993 8975 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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LAMA3Q16787 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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LAMA3Q16787 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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LAMA3Q16787 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 FZD10-AS1-201ENST00000505807 10193 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 ZNF365-204ENST00000395251 2695 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAMA3Q16787 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 SCYL3-202ENST00000367771 6364 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 LIMCH1-202ENST00000381753 5705 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 HIVEP2-203ENST00000367604 10032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAMA3Q16787 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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