Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
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PUM3Q15397 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
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PUM3Q15397 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PUM3Q15397 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
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