Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms