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| BRD3 | Q15059 | AP001439.1-201 | ENST00000455275 | 392 nt | TSL 2 BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | GTF2IP12-201 | ENST00000456547 | 356 nt | BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL161747.1-201 | ENST00000480068 | 358 nt | BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AF250324.1-203 | ENST00000508156 | 517 nt | TSL 3 BASIC | 6.02 | □□□□□ -1.45 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC018557.1-201 | ENST00000569274 | 1790 nt | TSL 5 BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF26-201 | ENST00000328654 | 17601 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | PIAS2-204 | ENST00000585916 | 11075 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | DNA2-201 | ENST00000358410 | 4208 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
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| BRD3 | Q15059 | RNA5SP241-201 | ENST00000391326 | 114 nt | BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | BCL11A-205 | ENST00000409351 | 756 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-603P-201 | ENST00000411403 | 107 nt | BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC016994.1-201 | ENST00000425419 | 552 nt | TSL 4 BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC01953-201 | ENST00000426870 | 717 nt | TSL 5 BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC211433.1-202 | ENST00000434256 | 1187 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL160004.1-201 | ENST00000434311 | 478 nt | TSL 3 BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC092162.2-201 | ENST00000438143 | 532 nt | TSL 4 BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC068135.1-201 | ENST00000446164 | 246 nt | BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC002553.3-201 | ENST00000453002 | 341 nt | BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
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| BRD3 | Q15059 | PSAT1P4-201 | ENST00000466500 | 526 nt | BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC010285.3-201 | ENST00000511668 | 676 nt | BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | RN7SKP35-201 | ENST00000517210 | 151 nt | BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC011853.1-201 | ENST00000518911 | 454 nt | BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC008575.1-201 | ENST00000520401 | 694 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | HGNC:24955-208 | ENST00000521585 | 1260 nt | TSL 4 BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | C8orf22-204 | ENST00000522267 | 739 nt | APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | LGALS8-217 | ENST00000525042 | 903 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP000620.1-201 | ENST00000527147 | 504 nt | BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP003066.2-201 | ENST00000529375 | 555 nt | BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP001893.1-201 | ENST00000532866 | 362 nt | TSL 5 BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | CCND2-AS2-201 | ENST00000537370 | 495 nt | TSL 4 BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP003037.1-201 | ENST00000537594 | 267 nt | TSL 5 BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | TRDN-204 | ENST00000542443 | 1294 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC007406.1-201 | ENST00000544067 | 315 nt | TSL 3 BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | BICD1-206 | ENST00000551086 | 423 nt | TSL 3 BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC01580-202 | ENST00000555364 | 661 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | POU1F1-203 | ENST00000560656 | 647 nt | TSL 5 BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC01572-205 | ENST00000570152 | 360 nt | TSL 3 BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC127024.5-201 | ENST00000580085 | 462 nt | BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC124916.2-201 | ENST00000604416 | 224 nt | BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
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| BRD3 | Q15059 | LINC00969-332 | ENST00000630874 | 738 nt | TSL 5 BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR8A1-204 | ENST00000642111 | 1145 nt | BASIC | 6.01 | □□□□□ -1.45 | | |
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