Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
R3HDM1Q15032 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms