Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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