Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ALCAMQ13740 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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