Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms