Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CDH18Q13634 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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