Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms