Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
IFT88Q13099 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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IFT88Q13099 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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IFT88Q13099 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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IFT88Q13099 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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IFT88Q13099 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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IFT88Q13099 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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