Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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GPS1Q13098 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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GPS1Q13098 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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GPS1Q13098 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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GPS1Q13098 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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GPS1Q13098 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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GPS1Q13098 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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GPS1Q13098 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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GPS1Q13098 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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GPS1Q13098 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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GPS1Q13098 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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GPS1Q13098 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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