Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AP003084.1-201ENST00000524828 742 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 MIR205HG-210ENST00000603283 455 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AL022238.3-201ENST00000609279 443 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 C18orf32-203ENST00000613385 5395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 EHF-201ENST00000257831 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 FRRS1-201ENST00000287474 2678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 LRRC40-201ENST00000370952 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 ZNF10-201ENST00000248211 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 PIWIL2-204ENST00000521356 3488 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 CAB39L-202ENST00000355854 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 SLC25A13-201ENST00000265631 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 WDHD1-202ENST00000420358 3722 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 APOL2-202ENST00000358502 2551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 R3HCC1L-203ENST00000370584 3372 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 ADCY10P1-203ENST00000567255 4569 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 LDB2-203ENST00000502640 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AC073525.1-203ENST00000547040 2631 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 AC006299.1-203ENST00000499625 2029 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 ZNF185-202ENST00000318529 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 AC233724.10-201ENST00000510454 409 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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FOXC1Q12948 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AC079362.1-202ENST00000547089 278 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
FOXC1Q12948 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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