Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 PCBP1-AS1-230ENST00000439670 2180 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC104066.2-201ENST00000564513 1741 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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