Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms