Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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PTPRCP08575 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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PTPRCP08575 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRCP08575 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTPRCP08575 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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