Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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ARL2-SNX15V9GYD0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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ARL2-SNX15V9GYD0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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ARL2-SNX15V9GYD0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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ARL2-SNX15V9GYD0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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ARL2-SNX15V9GYD0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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ARL2-SNX15V9GYD0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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