Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HDGFL3Q9Y3E1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HDGFL3Q9Y3E1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms