Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN88

GABRQ, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRQQ9UN88 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRQQ9UN88 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRQQ9UN88 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms