Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ZNF608Q9ULD9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZNF608Q9ULD9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZNF608Q9ULD9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
ZNF608Q9ULD9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZNF608Q9ULD9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZNF608Q9ULD9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZNF608Q9ULD9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZNF608Q9ULD9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZNF608Q9ULD9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZNF608Q9ULD9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZNF608Q9ULD9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZNF608Q9ULD9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZNF608Q9ULD9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZNF608Q9ULD9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZNF608Q9ULD9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZNF608Q9ULD9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZNF608Q9ULD9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZNF608Q9ULD9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZNF608Q9ULD9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZNF608Q9ULD9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZNF608Q9ULD9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZNF608Q9ULD9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF608Q9ULD9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms