Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PNMA3Q9UL41 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PNMA3Q9UL41 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms