Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP8AP2Q9UKL3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASP8AP2Q9UKL3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms