Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXD3Q9UJU5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXD3Q9UJU5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms