Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB6

LIMA1, LIM domain and actin-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMA1Q9UHB6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIMA1Q9UHB6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LIMA1Q9UHB6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms