Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK12Q9NYV4 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK12Q9NYV4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms