Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BRMS1Q9HCU9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRMS1Q9HCU9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms