Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ELL3Q9HB65 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ELL3Q9HB65 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms