Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NIFKQ9BYG3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NIFKQ9BYG3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms