Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SMG1Q96Q15 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMG1Q96Q15 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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