Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNBD2Q96M20 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms