Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ABCC12Q96J65 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms