Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC34Q96HJ3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC34Q96HJ3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms