Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BORCS6Q96GS4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS6Q96GS4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms