Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms