Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP9XQ93008 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
USP9XQ93008 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
USP9XQ93008 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
USP9XQ93008 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP9XQ93008 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
USP9XQ93008 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USP9XQ93008 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP9XQ93008 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP9XQ93008 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP9XQ93008 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP9XQ93008 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP9XQ93008 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP9XQ93008 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP9XQ93008 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
USP9XQ93008 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
USP9XQ93008 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP9XQ93008 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USP9XQ93008 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
USP9XQ93008 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms