Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD53Q8N9V6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ANKRD53Q8N9V6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms