Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD4Q8N4Q1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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CHCHD4Q8N4Q1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHCHD4Q8N4Q1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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