Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SVBPQ8N300 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms