Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SKAP1Q86WV1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SKAP1Q86WV1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms