Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC84Q86UT8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms