Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTOP1Q7RTM1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP1Q7RTM1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms