Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RHBDD2Q6NTF9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms