Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF18Q5VWM3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF18Q5VWM3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF18Q5VWM3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF18Q5VWM3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF18Q5VWM3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF18Q5VWM3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF18Q5VWM3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF18Q5VWM3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF18Q5VWM3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF18Q5VWM3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms