Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf17Q53FE4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4orf17Q53FE4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms