Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SLC39A12Q504Y0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A12Q504Y0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms