Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP21-3Q3LHN1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KRTAP21-3Q3LHN1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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