Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM187BQ17R55 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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