Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RYR3Q15413 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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