Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NCAPHQ15003 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NCAPHQ15003 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms