Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTCH1Q13635 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTCH1Q13635 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
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